Einige Unterschiede zwischen der ELKA und der Missouri-Synode sind ihr Verständnis der Bibelauslegung, die Rolle der Frauen im Dienst sowie der Glaube und die Praxis der Sakramente. Obwohl beide Konfessionen ein lutherisches Erbe teilen, haben diese Unterschiede führte zu einer stärkeren Spaltung zwischen ihnen.
Die Evangelisch-Lutherische Kirche und die Missouri Synod Lutheran Church waren nie ein vereintes Gremium, da die LCMS nie Teil der Organisationen war, die sich zur ELCA zusammengeschlossen haben. Die Unterschiede zwischen den beiden Körperschaften traten in den 1970er Jahren auf, als beide Kirchen unterschiedlich auf radikale Veränderungen in der damaligen Gesellschaft reagierten.
Obwohl beide Kirchen gemeinsame Glaubensbekenntnisse und Bekenntnisse teilen, unterscheiden sie sich in ihrem Verständnis der Bibelauslegung. Die ELKA umfasst eine historisch-kritische Bibelwissenschaft, die zu einer Vielzahl von Interpretationen führt, die die ELKA zulässt. Die LCMS steht bestimmten Formen kritischer Wissenschaft skeptischer gegenüber und glaubt, dass sie die biblische Autorität untergraben.
In den frühen 1970er Jahren begann die ELCA damit, Frauen zu pastoralen Leitern zu weihen. Heute gibt es auf allen Ebenen der ELKA Frauen im ordinierten Dienst, während die LCMS glaubt, dass die Bibel nur Männern erlaubt, als Pastoren zu dienen.
Das LCMS erlaubt nur vollberechtigten Mitgliedern der LCMS-Gemeinden, die Kommunion in seinen Gottesdiensten zu empfangen. Die ELCA erlaubt jedem getauften Christen, in einer ELCA-Kirche zu empfangen und hat Vollkommunion-Abkommen mit einer Reihe anderer protestantischer Konfessionen.
