Beispiele für natürliche Ökosysteme sind tropische Regenwälder, Grasland, Wüsten und Korallenriffe. Ein natürliches Ökosystem ist definiert als die biologische Gemeinschaft an einem bestimmten Ort sowie die physikalischen und chemischen Faktoren, die die Umwelt auf.
Tropische Regenwaldökosysteme haben eine sehr dichte Vegetation und eine größere Vielfalt an Tier- und Pflanzenarten als jede andere Art von Ökosystem.
Ein Grünland-Ökosystem besteht hauptsächlich aus Gras mit einigen Bäumen und Sträuchern. Savannengrasland hat eine große Anzahl von Weidetieren und Raubtieren. Prärierasen sind normalerweise frei von Sträuchern und Bäumen.
Ein Wüstenökosystem zeichnet sich durch ein trockenes Klima, spärliche Vegetation und sehr wenige Tiere und Insekten aus.
Korallenriff-Ökosysteme befinden sich unter der Oberfläche der Ozeane und beherbergen viele Arten von Korallen und Fischen.