Der Einsatz von Ultraschall in der Medizin hat mehrere Nachteile, von denen einer die Möglichkeit von Bedienungsfehlern ist. Einige Geräte erzeugen auch Bilder mit begrenzter Auflösung.
Ultraschall kann nicht verwendet werden, um einen Teil des Körpers zu untersuchen, der Gas enthält, und ist daher kein nützliches Werkzeug zur Diagnose von Problemen der Lunge und des Verdauungstrakts. Diese Art von Studie ist auch sehr begrenzt, wenn sie zur Identifizierung von Frakturen und anderen Problemen mit den Knochen verwendet wird.
Die CancerQuest-Website sagt, dass einige Ultraschalluntersuchungen zu falsch positiven Ergebnissen führen können, was dazu führt, dass Patienten sich Biopsien und anderen invasiven Verfahren unterziehen, die nicht erforderlich sind. Ultraschall ist auch nicht in der Lage, eine Verkalkung des Brustgewebes zu erkennen, was ihn für die Erkennung einiger Formen von Brustkrebs weniger nützlich macht.