Die Handlung im Zombie-Modus von "Call of Duty Black Ops 2" dreht sich um Edward Richtofen nach den Ereignissen des Mond-DLCs aus "Call of Duty Black Ops". Der Story-Modus mit dem Titel Tranzit ermöglicht es den Spielern, das Rätsel zu lösen, warum die Erde stirbt, während sie sich durch endlose Horden von Zombies kämpfen. Der Spieler erhält Unterstützung von Richtofen und Dr. Maxis.
Laut der offiziellen "Call of Duty"-Website hat der Zombie-Modus von "Call of Duty" zwar einen Handlungsbogen, ist aber aufgrund seiner endlosen Funktionen keine Kampagne. Auch der Tranzit-Modus in "Black Ops 2", der sich auf die Story-Aspekte konzentriert, ist in erster Linie ein Score-basiertes Spiel. "Black Ops 2" hat vier verschiedene Zombie-Modi. Tranzit ist eine endlose Horde von Zombies mit verschiedenen Story-Aspekten und einer offenen Welt. Der Survival-Modus findet in einem bestimmten Segment der offenen Welt von Tranzit statt und lässt die Spieler gegen eine endlose Horde antreten. Im Trauermodus treten Teams aus vier menschlichen Spielern gegeneinander sowie gegen Zombies an. Die Spieler können wählen, ob sie gegeneinander kämpfen oder versuchen, Zombies zu ihrem Vorteil zu nutzen. Schließlich ermöglichen benutzerdefinierte Spiele den Spielern, die Arten von Gegenständen, die Möglichkeiten zum Töten von Zombies und das Zeitlimit ihres Spiels anzupassen.
