Ein Flusssystem ist eine Möglichkeit, die größeren Netze von Bächen, Seen und Flüssen zu beschreiben, die Teil des Netzes von Neben- und Nebenflüssen eines größeren Flusses sind; zum Beispiel münden mehrere Flüsse, darunter die Flüsse Ohio, Red und Missouri, in den Mississippi, dienen als Nebenflüsse und sind Teil des Systems des Mississippi. Diese Wasserstraßen sind miteinander verbunden und die Gesundheit eines dieser Flüsse kann Auswirkungen auf andere Wasserstraßen im gleichen Flusssystem. Darüber hinaus kann Land Teil eines Flusssystems sein, wie zum Beispiel Überschwemmungsgebiete und Feuchtgebiete, die von einem Hauptfluss und seinen Neben- und Nebenflüssen beeinflusst werden.
In den meisten Fällen haben Flüsse eine Hauptquelle, z. B. Schneeschmelze von einem Berg, der in mehrere Bäche fließt, die sich dann zu einem Fluss zusammenschließen, der in einen viel größeren Fluss mündet. Dies ist ein Beispiel für ein Flusssystem. Aus ökologischer Sicht sind Flusssysteme Ökosysteme, die negative Auswirkungen auf Dinge wie die Wasserqualität und die Gesundheit von Pflanzen und Tieren haben können, wenn nur ein Teil des Systems verschmutzt oder beschädigt wird. Wenn beispielsweise die Quelle eines Flusses stark verschmutzt ist oder eine schwere Dürre herrscht, wird dies in allen Wasserstraßen und Landflächen des Flusssystems spürbar.
