Die negativen Aspekte der Energie aus Biomasse ähneln denen, die mit der Verwendung fossiler Brennstoffe zur Stromerzeugung verbunden sind, mit der Ausnahme, dass es sich bei Biomasse-Brennstoffen um erneuerbare Energiequellen handelt. Die Verbrennung von Biomasse-Brennstoffen führt zu Bedenken hinsichtlich der Emissionen und Wasserverbrauch. Biomassebrennstoffe sind weniger effizient und benötigen mehr Land.
Biomasseenergie verwendet Brennstoff aus pflanzlichen und tierischen Quellen. Zu diesen Quellen gehören Abfälle wie Holzhackschnitzel, Abwasser, Mist und verrottete Bäume, aber auch Pflanzen, die speziell für die Umwandlung von Biomasse angebaut werden. Während die Menschen Holz seit Jahrhunderten als Wärmequelle nutzen, nutzt Biomasseenergie diesen Brennstoff, um Motoren oder Stromerzeugungsanlagen anzutreiben. Die Erzeugung der Brennstoffquelle ist jedoch oft teuer, selbst wenn dabei Abfallprodukte verbraucht werden.
Während die Energie aus Biomasse zur Reduzierung der Kohlendioxidemissionen beiträgt, erhöht sie andere Treibhausgase, einschließlich Methan. Aus ökologischer Sicht sind die Emissionen einer Biomasseanlage genauso schädlich wie die von fossilen Brennstoffen. Auch die Verwendung von Abfällen von Tieren und Menschen erzeugt unerwünschte Gerüche.
Da Biomasseenergie Methangas produziert, benötigt sie mehr Land als andere Arten der Energieerzeugung, um die in der Nähe der Anlage lebenden Menschen zu schützen. Wenn die Nachfrage nach zusätzlicher Biomasse die verfügbaren Abfallprodukte übersteigt, besteht für Landwirte die Möglichkeit, von Nahrungspflanzen auf Biomassepflanzen umzustellen, was die Verfügbarkeit von Nahrungsmitteln verringert. Die Nachfrage hat auch das Potenzial, bereits gestresste Wälder weiter zu belasten.