Seit Juli 2015 können die meisten Passagiere mit Sun Country Airlines online einchecken und ihre Bordkarten zu Hause ausdrucken. Dies gilt auch für Passagiere, die auf Inlandsflügen fliegen. Passagiere, die mit einem internationalen Flug reisen, müssen an einem Sun Country-Ticketschalter am Flughafen einchecken und ihre Bordkarte ausdrucken lassen.
Passagiere von Sun Country Airlines können ab 24 Stunden vor der Abflugzeit ihres Fluges online einchecken. Der Online-Check-in endet 6 Stunden vor der Abflugzeit. Passagiere, die mit Kleinkindern, in einer Gruppe von mehr als sieben Personen oder als unbegleitete Minderjährige fliegen, können nicht online einchecken oder ihre Bordkarte zu Hause ausdrucken.