Antibiotika können ein Ungleichgewicht bei der Produktion von Östrogen und Progesteron im Körper verursachen, was wiederum einen unregelmäßigen Menstruationszyklus verzögern oder verursachen kann, so der Menstruationszyklus-Rechner. Antibiotika beeinträchtigen auch die Stoffwechselleistung des Körpers und die Regulierung von Hormonen, was die Wirksamkeit der Geburtenkontrolle verringern kann.
Da Antibiotika über die Leber aufgenommen werden, wo Östrogen und Progesteron metabolisiert werden, wird die Hormonstoffwechselrate laut Menstruationszyklus-Rechner beeinflusst. Diese Änderung der Stoffwechselrate beeinflusst die Östrogenmenge im Blut, was zu einem unregelmäßigen Zyklus führen kann, da falsche Informationen an die Hypophyse gesendet werden.