Fernbedienungen, die mit einem Fernseher, einer Kabelbox oder einem anderen Gerät geliefert werden, müssen normalerweise nicht programmiert werden, Universalfernbedienungen jedoch im Allgemeinen. Der Programmiervorgang einer Fernbedienung variiert je nach Hersteller .
Fernseher und Geräte, die sie steuern, verwenden einzigartige Infrarot-Blinkfrequenzen, um richtig zu funktionieren; Beim Programmieren einer Fernbedienung muss die Fernbedienung so eingestellt werden, dass sie die richtigen Frequenzen verwendet. Viele Universal-Fernbedienungen verfügen über eine automatische Einrichtungsfunktion; Benutzer aktivieren diesen Modus und drücken eine Taste, bis der Fernseher oder das Gerät reagiert. Sie programmieren dann die Fernbedienung, um diese Einstellung zu verwenden. Bei vielen Modellen können Benutzer auch Codes für verschiedene Hersteller manuell eingeben. Dies kann jedoch mehrere Versuche erfordern, bevor der richtige Code gefunden wird.