Das als Nil bekannte System fließt durch die Länder Tansania, Uganda, Ruanda, Burundi, die Demokratische Republik Kongo, Kenia, Äthiopien, Eritrea, Südsudan, Sudan und Ägypten. Die Länder, durch die der Weiße Nil fließt, sind der Sudan, der Südsudan, Ruanda, Tansania, Uganda und die Demokratische Republik Kongo. Der Blaue Nil fließt durch Äthiopien und den Sudan. Der größte Teil des Nils fließt durch den Sudan und Ägypten.
Der Weiße Nil ist die Hauptquelle des Nils und beginnt an den Treffpunkten der Flüsse, die aus der Region der Großen Seen in Afrika fließen. Die zweite Hauptquelle des Nils ist der Blaue Nil, der am Tana-See in Äthiopien beginnt. Wenn diese Flüsse zusammenfließen, ist der resultierende Fluss einfach als Nil bekannt. Weitere Quellen, die als Teil des Nils gelten, sind der Ruvyironza-Fluss in Burundi und der Nyabarongo-Fluss in Ruanda. Der Teil des Flusses, der vom Viktoriasee in Uganda abfließt, wird als Victoria-Nil bezeichnet. Insgesamt erstreckt sich das Flusssystem, das als Nil gilt, über eine Gesamtlänge von 4.258 Meilen, wobei die Mündung des Flusses entlang der ägyptischen Küste des Mittelmeers liegt. Die wichtigsten Städte, durch die er fließt, sind Juba im Südsudan, Kairo in Ägypten, Khartum im Sudan und Jinja in Uganda.