Als Jodophor, kombiniert mit einer löslichmachenden Lösung oder einem Träger, wird angenommen, dass Jod desinfizierende Eigenschaften aufweist, da es die Zellwände eines Organismus durchdringt und die Protein- und Nukleinsäurestruktur und -synthese stört. Diese Lösungen sind sowohl als Desinfektionsmittel als auch als Antiseptika nützlich.
Jodlösungen werden in einer Vielzahl von Umgebungen verwendet, in denen eine antiseptische oder desinfizierende Wirkung erforderlich ist. Im Gesundheitswesen werden sie zur Desinfektion von Geräten wie Blutkulturflaschen, Thermometern, Hydrotherapietanks und Endoskopen verwendet.
Iodophor-Lösungen werden aufgrund von Konzentrationsunterschieden nicht als Desinfektionsmittel für harte Oberflächen empfohlen. Sie werden auch nicht für die Verwendung mit Silikonkathetern empfohlen, da das Material möglicherweise zerstört wird.