Cabo San Lucas hat einen kleinen Flugplatz, den internationalen Flughafen Cabo San Lucas. Er dient hauptsächlich dem Flugtaxiverkehr und der allgemeinen Luftfahrt. Der kommerzielle Flugverkehr in dieses Gebiet wird vom internationalen Flughafen Los Cabos abgewickelt, der sich in San José del Cabo befindet, 47 km von Cabo San Lucas entfernt.
Der internationale Flughafen Los Cabos ist der wichtigste Flughafen der Region Los Cabos und bedient jährlich etwa 3,35 Millionen Passagiere. Damit ist er der siebtgrößte Flughafen Mexikos. Ab 2015 beherbergt der Flughafen drei Terminals, ein weiteres befindet sich im Bau, und beherbergt 22 internationale und inländische Fluggesellschaften. Zu den weiteren Annehmlichkeiten zählen vier Hotels, zahlreiche Restaurants, Shuttleservices und Parkmöglichkeiten.