Zu den seltenen Pokemon-Karten gehören die holografische Glurak-Karte der ersten Ausgabe, die holografische Raichu-Vorabversion und die Illustrator-Pikachu-Karte. Die Glurak- und Raichu-Karten wurden beide in Sets veröffentlicht, während die Illustratorin Pikachu eine Werbekarte.
Die holografische Glurak-Karte der ersten Ausgabe war im ersten Pokémon-Kartensatz enthalten. Eine schattenlose Version der Karte, die nicht die Standard-Schattenfase im Hauptbild hat, ist die seltenere und wertvollere Version. Schattenlose Versionen der Karte mit einem hohen Zustand sind ab 2015 über 1.000 US-Dollar wert.
Auf der Pre-Release-Raichu-Karte ist in der unteren rechten Ecke des Hauptbilds das Wort "Prerelease" eingestanzt. Nur acht der Raichu-Karten haben diesen Stempel, was einen Wert von etwa 10.000 US-Dollar ergibt.
CoroCoro, ein Magazin, das einst Pokemon verkaufte, hat die Illustrator-Pikachu-Karten erstellt. Es gab die Karten, die ein Bild von Pikachu zeigen, der einen Pinsel hält, an Gewinner eines Pokemon-Karten-Illustrationswettbewerbs. Nur sechs dieser Karten existieren. Unbewertete Illustrator-Pikachu-Karten werden für 20.000 US-Dollar verkauft, und diejenigen mit hoher Qualität sind viel mehr wert.
Die meisten Pokemon-Karten haben ein Seltenheitssymbol in der unteren rechten Ecke. Dieses Seltenheitssymbol zeigt an, wie oft die Karte in Boosterpackungen vorkommt.