Zwei der großen Flüsse Mexikos beginnen im Bundesstaat Colorado: der Rio Bravo, der nördlich der Grenze als Rio Grande bekannt ist, und der Colorado River. Der Colorado River liegt hauptsächlich in Colorado und fließt nach Süden, überquert die Grenze in den Nordwesten Mexikos, wo er in das Meer von Cortez mündet, auch bekannt als Golf von Kalifornien. Der Rio Bravo, der etwa 1.250 Meilen der Grenze zwischen Mexiko und den USA bildet, wird gelegentlich seine Position durch Überschwemmungen verschieben, was zu Grenzstreitigkeiten führt.
Der Grijalva-Usumacinto ist der mexikanische Fluss mit dem höchsten Durchfluss und beginnt wie der Rio Bravo und Colorado außerhalb des Landes. Dieses Flusssystem hat seinen Ursprung in Guatemala und hat einen Doppelnamen, da es aus zwei Ästen ähnlicher Länge besteht. Die beiden Zweige vereinen sich im südöstlichen mexikanischen Bundesstaat Tabasco, bevor sie in den Golf von Mexiko münden.
Der längste Fluss, der vollständig innerhalb Mexikos liegt und etwa 800 Meilen fließt, ist das Flusssystem Lerma-Santiago. Er beginnt als Lerma-Fluss, mündet dann in den Chapala-See und mündet schließlich als Santiago-Fluss in den Pazifischen Ozean. Der Lerma-Santiago gilt aufgrund seines Wertes für die Wirtschaft des Landes als einer der wichtigsten Flüsse Mexikos. Er fließt durch mehrere mexikanische Bundesstaaten und versorgt erstklassige landwirtschaftliche Flächen mit Wasser.