Mögliche Nebenwirkungen eines Zungenpiercings sind Infektionen, Krankheitsübertragung, starke Blutungen und Nervenschäden. Eine weitere mögliche Nebenwirkung ist Endokarditis, die entsteht, wenn Bakterien in den Blutkreislauf und das Herz oder seine Klappen gelangen sich entzünden.
Weitere Nebenwirkungen können allergische Reaktionen auf Metall beinhalten. Auch Zahnfleischerkrankungen sind möglich, insbesondere bei Piercings mit längerem Stiel. Zahnprobleme können auch auftreten, weil Zähne nach dem Kontakt mit Zungenpiercings abplatzen oder brechen können. Das tägliche Leben kann schwieriger werden, da das Kauen und Schlucken von Nahrung Probleme bereiten. Der Geschmack kann sich ändern und eine klare Sprache kann ein Problem sein. Es kann zu Sabbern kommen und das Zungenpiercing stellt eine Erstickungsgefahr dar.