Software, die Java-Codierung verwendet, wird als binäre oder ausführbare Datei betrachtet, die auf der Java-Plattform ausgeführt wird. Der SE-Teil steht für Standard Edition, die üblicherweise auf Computern installiert wird, um die Java-Plattform für webbasierte Anwendungen und Spiele wie "Minecraft" bereitzustellen.
Programmierer, die Java verwenden, erstellen Software und Programme unter Verwendung der Programmiersprache, aber viele Programme erfordern auch, dass Java auf dem Computer des Benutzers installiert ist. Die installierte Java-Software stellt die Plattform für den auszuführenden Code bereit. Die Software muss bestimmte erwartete Komponenten auf dem Computer enthalten, um ordnungsgemäß zu funktionieren. Probleme, die von Java-Binärdateien herrühren, erfordern oft das Entfernen alter Java-Versionen, da Software, die für die Verwendung der Plattform entwickelt wurde, möglicherweise Funktionen in neueren Builds erfordert.