Die Geschichte der EFCC in Nigeria, ein Akronym für die Economic and Financial Crimes Commission, begann mit ihrer Einrichtung im Jahr 2003. Seit ihrer Gründung ist es der Kommission gelungen, mehrere hochrangige . strafrechtlich zu verfolgen und zu verurteilen Personen wegen Korruptionsvorwürfen, darunter mehrere Bankmanager und Regierungsbeamte.
Bemerkenswerte Ereignisse in der Geschichte der Organisation sind auch die Ermittlungen gegen Iyabo Obasanjo-Bello im Jahr 2008, die unter dem Verdacht der Bestechung mit Mitteln des Gesundheitsministeriums stehen. Der Fall führte zu einem Prozess gegen die damalige Gesundheitsministerin und ihren Stellvertreter, der angeklagt wurde, etwa 300.000 US-Dollar aus ungenutzten Mitteln, die dem Ministerium zugewiesen wurden, gestohlen zu haben.
Am 14. September 2010 wurde Abdullahi Muazu, der als Leiter der forensischen Einheit der EFCC diente, in Kaduna ermordet. Vor seinem Tod war er aktiv an Prozessen beteiligt, an denen mehrere einflussreiche Bankchefs in Nigeria beteiligt waren.
Die Gerichtsbarkeit der EFCC in Nigeria ist auf Finanzkriminalität beschränkt. Ab 2014 untersteht die Kommission direkt dem Präsidenten von Nigeria. Dies ermöglicht es dem amtierenden Präsidenten, den Vorsitzenden des EFCC zu ernennen und zu entlassen. Ein solcher Fall ereignete sich am 23. November 2011, als Präsident Goodluck Jonathan die Vorsitzende Farida Mzamber Waziri entließ und sie durch Ibrahim Lamorde ersetzte.