Der Hauptunterschied zwischen Nidoking und Nidoqueen besteht darin, dass sie aus verschiedenen Geschlechterlinien der Nidoraner stammen. Oberflächlich betrachtet sind die beiden Pokémon mit Ausnahme der Grundzahlen fast gleich. Sie besitzen sehr ähnliche Bewegungssets, sie sind beide Gift-/Boden-Pokémon und stammen aus ähnlichen Evolutionslinien.
Diese Ungleichheit zwischen den Geschlechtern ist das erste und bekannteste Beispiel in der Pokémon-Serie. Das Geschlecht als vollständige Spielmechanik wurde erstmals in der zweiten Generation von Spielen eingeführt, aber die Nidoraner zeigten ein grundlegendes Beispiel dafür, was es in späteren Generationen werden würde. Selbst in den neuesten Versionen weisen die Nidoran-Linien mehr Unterschiede zwischen ihren Geschlechtern auf als andere, da sie als eine der ganz wenigen unterschiedliche Strategien und Stärken ausschließlich abhängig von ihrem Geschlecht entwickeln.
Die Nidoran-Linien gelten als voneinander getrennte Arten, aber sie sind perfekt miteinander vereinbar. Leider wird dies aufgrund von Macken mit der Funktionsweise der Pokémon-Zucht zu Beginn der Serie nicht vollständig durch ihre evolutionären Linien getragen. Seltsamerweise verliert ein nidoranisches Weibchen, sobald es sich zu einer Nidorina entwickelt hat, jegliche Eikompatibilität, was es unmöglich macht, mit etwas anderem als einem Ditto zu züchten.
