Während Charles Krauthammers erstem Schuljahr in Harvard, als er den Unterricht schwänzte, um mit seinem Freund Tennis zu spielen, tauchte er nach dem Spiel in einen Pool, um sich abzukühlen, und brach sich dabei das Genick. Dieser Unfall führte dazu, dass er C5-6 Tetraplegiker wurde und seitdem im Rollstuhl sitzt.
In einem Reportage-Special von Fox News beschrieb Krauthammer die Einzelheiten des Vorfalls, bei dem er im Alter von nur 22 Jahren gelähmt wurde. Zum Zeitpunkt seiner Verletzung erinnert er sich, dass er den Morgenunterricht ausgelassen hat, um mit seinem Freund Tennis zu spielen. Als sie mit ihrem Spiel fertig waren, machten sie sich auf den Weg zum Nachmittagsunterricht und beschlossen, zuerst kurz schwimmen zu gehen. Krauthammer sagte, dass sie ein paar Tauchgänge in den Pool gemacht haben, und er ist mit dem Kopf auf den Boden des Pools gestoßen.
Während er sich den Kopf aufschlug, gab es an seinem Kopf selbst keine Anzeichen eines Traumas. Der Aufprall konzentrierte die gesamte Kraft auf eine bestimmte Stelle seines Rückenmarks, was zu einer lähmenden Verletzung seiner Halswirbel führte. Er konnte sich nicht vom Boden des Beckens bewegen. Ironischerweise studierte er zum Zeitpunkt des Unfalls in seinem Unterricht über das Rückenmark.