Alternativen zu herkömmlichen Kläranlagen zu Hause umfassen rezirkulierende Sandfilter, Komposttoiletten, Verdunstungs- und Transpirations-Kläranlagen und aerobe Systeme. Ob diese oder andere alternative Methoden weniger kosten als herkömmliche Systeme, hängt von zahlreichen Faktoren ab, wie z
Alternative Abfallbehandlungsmethoden können traditionellen Kläranlagen ähnlich sein, z. B. Grauwassersystemen, oder Methoden, die den Abfall zerstören, z. Weitere Methoden sind Lagunen- und Hochbeetsysteme.
Aerobe Kläranlagen behandeln Abwasser mit desinfizierenden Chemikalien, sodass das Wasser ohne Verwendung einer Klärgrube in das Grundwasser eingeleitet werden kann.
Bestimmungen in einigen Gebieten verbieten bestimmte Arten von Kläranlagen, oft aufgrund des Wasserspiegels oder anderer Landnutzungskriterien.