Charles Krauthammer wurde 1950 in New York geboren und zog als Kind mit seinen Eltern ins französischsprachige Kanada. Er war mit der Malerin und Bildhauerin Robyn Krauthammer verheiratet und hat einen Sohn namens Daniel, der geboren 1986. Sowohl Charles als auch Robyn Krauthammer waren Förderer jüdischer Musik und Kultur und sind Mitbegründer von "Pro Musica Hebraica", einer Kulturorganisation mit Sitz in Washington. Beide haben sich schon immer für jüdische Kultur und Traditionen interessiert. Dr. Krauthammer verstarb am 21. Juni 2018 an Dünndarmkrebs.
Charles Krauthammer wuchs in einer streng orthodoxen jüdischen Familie auf. Sein Vater war französischer Abstammung und seine Mutter wurde in Belgien geboren. Sie beschlossen, von New York nach Montreal zu ziehen, als Charles jung war. Er führte ein sehr privates Leben und teilte der Öffentlichkeit selten Details über seine Familie mit, mit Ausnahme einiger Hinweise auf seinen Sohn Daniel in seinem Buch "Things That Matter". 1974 heiratete er Robyn Krauthammer und beide sprachen fließend Hebräisch. Gemeinsam leiteten sie eine Kulturorganisation, die Konzerte zur Förderung jüdischer Musik organisiert. Die beiden lernten sich während ihres Studiums an der Oxford University in England kennen. Zu dieser Zeit war Robyn eine jüdisch-australische Studentin, die auch als Rechtsreferendarin für das Büro des Obersten Richters arbeitete.
