Die Metro-North Railroad hat wichtige Haltestellen in New Haven, Connecticut; Poughkeepsie, New York und Port Jervis, New York. Dieses Netz besteht aus drei Bahnlinien östlich des Hudson River und zwei Bahnlinien westlich des Hudson River. Die östlichen Linien stammen vom Grand Central Terminal, während die westlichen Linien von der Penn Station ausgehen. Die westlichen Linien halten auch in Städten von New Jersey.
Die drei östlichen Linien sind die New Haven Line, die Harlem Line und die Hudson Line. Die New Haven Line folgt der Nordküste des Long Island Sound, wenn sie Connecticut erreicht. Zu den wichtigsten Haltestellen dieser Linie gehören New Rochelle, New York; Stamford, Connecticut; Bridgeport, Connecticut und New Haven, Connecticut. Diese Linie hat auch Verlängerungen zu den Connecticut-Städten New Canaan, Danbury und Waterbury.
Die Harlem Line verläuft entlang der Grenze zwischen New York und Connecticut. Zu den wichtigsten Haltestellen dieser Linie gehören die New Yorker Städte White Plains, Mount Kisco und Wassaic. Die Hudson Line folgt dem östlichen Ufer des Hudson River. Zu den wichtigsten Haltestellen dieser Linie gehören die New Yorker Städte Yonkers, Tarrytown, Peekskill und Poughkeepsie.
Die beiden westlichen Linien sind die Pasack Valley Line und die Port Jervis Line. Die Pasack Valley Line liegt näher am Westufer des Hudson River als die Port Jervis Line. Zu den wichtigsten Haltestellen entlang der Pasack Valley Line gehören East Rutherford, New Jersey und Spring Valley, New York. Zu den wichtigsten Haltestellen entlang der Port Jervis Line gehören Patterson, New Jersey; Tuxedo, New York und Port Jervis, New York.