Bei gesunden Personen ist die einzige häufige Nebenwirkung von Probiotika leichte Verdauungsbeschwerden, wie zum Beispiel in Form von Blähungen, so das National Center for Complementary and Integrative Health. Im Jahr 2015 haben Wissenschaftler jedoch noch einige Unsicherheiten über die langfristige Sicherheit der Einnahme von Probiotika, und es sind weitere Forschungen erforderlich. Die Einnahme von Probiotika kann bei Menschen, die kürzlich operiert wurden, schwer krank sind oder ein geschwächtes Immunsystem haben, schwere Infektionen verursachen.
Nicht alle probiotischen Produkte enthalten die gleichen Bakterienstränge, was bedeutet, dass einige Produkte möglicherweise sicherer sind als andere, stellt das National Center for Complementary and Integrative Health fest. Zum Beispiel zeigten die Ergebnisse einer Studie, dass ein bestimmter Lactobacillus-Strang für gesunde Personen über 65 Jahren sicher zu sein scheint, aber die Studie ist kein ausreichender Beweis dafür, dass die Verwendung von Probiotika im Allgemeinen bei älteren Menschen sicher ist.
Trotz der Behauptung, dass Probiotika bei der Behandlung einer Vielzahl von Gesundheitszuständen hilfreich sind, gibt es nur wenige oder keine wissenschaftlichen Beweise, warnt das National Center for Complementary and Integrative Health. Es gibt Hinweise darauf, dass probiotische Nahrungsergänzungsmittel Durchfall bei Menschen verhindern, die Antibiotika einnehmen oder an bestimmten Infektionen leiden. Es gibt auch Hinweise darauf, dass Probiotika die Symptome des Reizdarmsyndroms lindern können. Es ist mehr Forschung erforderlich, um festzustellen, welche spezifischen Probiotika diese Vorteile am effektivsten bieten und wie viel Patienten diese einnehmen müssen, um diese Vorteile zu erzielen.