Pflanzenwurzeln sind Strukturen, die entwickelt wurden, um Nährstoffe und Feuchtigkeit aus dem Boden zu ziehen, während Knollen als Speichergefäße und als Mittel zur Vermehrung neuer Pflanzen dienen. Pflanzen bilden Knollen an ihren Wurzeln und beiden Stängeln. Stammknollen enthalten Stammzellen, die es Pflanzen ermöglichen, sich zu vermehren, indem sie neue Stängel und Blätter bilden. Wurzelknollen sind keine echten Knollen, da sie keine Stammzellen oder geschwärzte Blätter haben.
Die gewöhnliche Kartoffel ist eine Stängelknolle. Wenn Kartoffeln aus Samen gepflanzt werden, wachsen Ableger aus dem Stängel in Bodennähe, oft so nah, dass der Boden sie schließlich bedeckt. In der Natur ruhen diese Knollen bei kühlerem Wetter, dann bilden sich Sprossen, wenn sich der Boden erwärmt, und vermehren sich schließlich zu neuen, genetisch identischen Pflanzen. Die Basis der Knolle bildet das Wurzelsystem, während die Spitze die neuen Stängel und Blätter bildet.
Süßkartoffeln sind Wurzelknollen. Sie bilden sich an Rhizomen oder horizontalen Wurzeln der Pflanze. Wurzelknollen bestehen nur aus Wurzelzellen. Um Wurzelknollen zu vermehren, benötigt jede Pflanze einen Teil der Wurzelkappe, der neue Stammzellen bildet.
Karotten, Rüben und Rüben sind echte Hackfrüchte und keine Knollen. Während diese modifizierten Pfahlwurzeln Energie speichern, vermehren sie keine neuen Pflanzen.
