Nicht alle bei GNC verkauften Produkte sind sicher. Beispiele für unsichere Produkte in GNC-Geschäften sind Jack3d, OxyElite Pro und Craze. Im Jahr 2013 berichtete WTAE Pittsburgh, dass GNC freiwillig 1.542 Produktkisten zerstörte die als möglicherweise unsicher eingestuft wurden.
Jack3d enthält Dimethylamylamin oder DMAA, ein ähnliches Produkt wie Methamphetamin. Laut der New York Times könnte dieses Produkt 2011 am Tod eines ansonsten gesunden 22-jährigen Soldaten der Armee beteiligt gewesen sein.
OxyElite Pro enthält auch DMAA und wurde laut Boston Magazine mit akuter Hepatitis in Verbindung gebracht. Unmarkiertes Methamphetamin wurde auch in Craze gefunden, einem Pre-Workout-Präparat, das bei GNC verkauft wird.
Im Jahr 2013 zerstörte GNC OxyElite Pro und Jack3d im Wert von 500.000 US-Dollar freiwillig, da Bedenken hinsichtlich der Sicherheit der Produkte laut WTAE Pittsburgh geäußert wurden. Nahrungsergänzungsmittel wie Jack3d und OxyElite Pro werden nicht von der US-amerikanischen Food and Drug Administration reguliert.