Ab 2015 sind einige Fluggesellschaften, die Boise, Idaho, abfliegen, kommerzielle Fluggesellschaften wie Allegiant Air, United Airlines und Southwest. Andere kommerzielle Fluggesellschaften, die vom Flughafen Boise abfliegen, sind Alaska Airlines, Delta Airlines und American Airlines. Jede dieser großen Fluggesellschaften bedient 16 Städte mit täglichen Nonstop-Flügen.
Der Flughafen Boise wird auch von Charterflugzeugen, Lufttaxis und Pendlerflugzeugen wie Turbo Air, Mountain Aviation, Western Aircraft, Jackson Jet Center und McCall Aviation bedient. Western Air Express- und Gem Air-Flüge sind zusätzliche Charter- und andere Linienflüge, die vom Flughafen Boise abfliegen. Der Flughafen Boise ist täglich rund um die Uhr geöffnet.
Passagiere finden Kioske und Ticketschalter im zweiten Stock des Flughafenterminals. Andere Liniendienste und Charterdienste haben Ticketschalter im ersten Stock des Terminals. Jede Fluggesellschaft, die den Flughafen bedient, hat ihre eigenen Ticketverkaufszeiten.
Jede der kommerziellen Fluggesellschaften akzeptiert mobile Bordkarten mit Ausnahme von American Airlines. Passagiere können ihr Gepäck auch an den Terminals von Southwest Airlines und Delta Airlines am Bordstein aufgeben. Im Juni 2015 beförderte der Flughafen Boise jährlich mehr als 1,4 Millionen Passagiere. Zu den beliebtesten Zielen, die Passagiere des Flughafens Boise anfliegen, gehören Denver, Colorado und Seattle, Washington.