Eine Hirschmaus ist an ihrer langen, dreieckigen Nase und ihren großen, schwarzen Augen zu erkennen. Die Hirschmaus hat oft eine braune Farbe, während eine gewöhnliche Hausmaus normalerweise grau ist.
Die Oberseite der Hirschmaus ist braun bis rötlich und der Bauch der Maus ist weiß. Die Hirschmaus hat große, abgerundete Ohren mit spärlichem Fell. Hirschmäuse haben lange Schwänze, die oben rötlich oder braun und unten weiß sind. Gewöhnliche Mäuse haben einen dunkel gefärbten, haarlosen Schwanz, der normalerweise einheitlich gefärbt ist. Hirschmäuse können auch grau und weiß sein, anstatt rötlich oder braun, abhängig von der Region, in der die Maus lebt. Sowohl graue als auch braune Hirschmäuse haben einen weißen Unterbauch und einen zweifarbigen Schwanz.
Reife Hausmäuse sind größer als Hirschmäuse. Die typische Größe einer ausgewachsenen Hirschmaus beträgt etwa 4 Zoll oder 7 Zoll einschließlich des Schwanzes. Eine gewöhnliche Maus erreicht eine Länge von bis zu 8 Zoll.
Die Hinterfüße von Hirschmäusen sind oft kleiner als die von Hausmäusen. Darüber hinaus ist die Farbtrennung bei Hirschmäusen deutlich erkennbar, während bei einer gewöhnlichen Maus Farben auftreten, die sich allmählich vermischen. Die Farbunterschiede zwischen Hirschmäusen und Hausmäusen sind besonders bei der Untersuchung von Schwänzen zu erkennen.
