Brunnenwasser kann verschmutzt werden, wenn das Brunnensystem nicht gewartet wird, was zu einer Verschlechterung führen kann. Brunnen müssen möglicherweise gereinigt werden, und da manche Leute dies nie tun, wird das Wasser kann schmutzig werden.
Dies kann in nur wenigen Jahren passieren, wenn der Brunnen nicht richtig gereinigt wird. Zu viel Eisen-, Mangan- und Schwefelwasserstoffgas kann zu einer Verunreinigung des Brunnenwassers führen. Menschen, die dieses Problem haben, können einen unangenehmen Geruch aus ihrem Wassersystem bemerken. Dies kann zu einem erheblichen Problem werden und ein Haus mit einem kanalartigen oder schwefeligen Geruch füllen.
Wells können auch mit Bakterien wie Coliformen und anderen Bakterienarten kontaminiert werden. Eine heterotrophe Plattenzählung kann verwendet werden, um herauszufinden, wie viele Bakterien sich im Wasser befinden. Dieser Test kann zwar nicht sehr spezifisch sein, liefert aber eine gute Zusammenfassung des Zustands des Bohrlochs.
Wenn Bakterien ein Problem werden, müssen die Wells gereinigt und dekontaminiert werden. Geschieht dies nicht, wird der Brunnen zum Nährboden für die Bakterien. Die Bakterien können in gewaschene Kleidung, Teller, Geräte und auf den Körper von Menschen gelangen, wenn sie versuchen zu duschen. Das ist nicht nur schmutzig, sondern auch ungesund, da diese Bakterien Krankheiten verursachen können.